玉帝殿是大埔隱廬樓上的主殿，位於大埔堂樓上的中廳。

　　神龕的最上層主位是奉祀「萬天至尊玄穹高上帝」的畫像。神龕中層從右至左依次奉祀五教始祖與民間神祇：觀音菩薩、孚佑帝君、耶穌基督、太上老君、孔聖先師、釋迦牟尼、謨罕默德、關聖帝君、齊天大聖。神龕下層祀奉眾位醫聖醫靈。